Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Msgn1Q9JK54 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms