Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnga3Q9JJZ8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms