Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ddx20Q9JJY4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx20Q9JJY4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms