Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smpd3Q9JJY3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd3Q9JJY3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms