Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT0

Rcl1, RNA 3'-terminal phosphate cyclase-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcl1Q9JJT0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rcl1Q9JJT0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rcl1Q9JJT0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rcl1Q9JJT0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rcl1Q9JJT0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rcl1Q9JJT0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rcl1Q9JJT0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rcl1Q9JJT0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rcl1Q9JJT0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcl1Q9JJT0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcl1Q9JJT0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcl1Q9JJT0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcl1Q9JJT0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcl1Q9JJT0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcl1Q9JJT0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcl1Q9JJT0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcl1Q9JJT0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcl1Q9JJT0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcl1Q9JJT0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcl1Q9JJT0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcl1Q9JJT0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcl1Q9JJT0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcl1Q9JJT0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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