Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efcc1Q9JJF6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms