Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LratQ9JI60 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LratQ9JI60 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms