Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htr3bQ9JHJ5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htr3bQ9JHJ5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htr3bQ9JHJ5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htr3bQ9JHJ5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htr3bQ9JHJ5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htr3bQ9JHJ5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Htr3bQ9JHJ5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Htr3bQ9JHJ5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Htr3bQ9JHJ5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Htr3bQ9JHJ5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Htr3bQ9JHJ5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Htr3bQ9JHJ5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms