Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Tmod3Q9JHJ0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Tmod3Q9JHJ0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
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Tmod3Q9JHJ0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmod3Q9JHJ0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Tmod3Q9JHJ0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Tmod3Q9JHJ0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Tmod3Q9JHJ0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Tmod3Q9JHJ0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Tmod3Q9JHJ0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Tmod3Q9JHJ0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmod3Q9JHJ0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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