Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tm9sf3Q9ET30 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf3Q9ET30 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms