Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hapln2Q9ESM3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hapln2Q9ESM3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms