Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms