Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tlnrd1Q9ERE8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms