Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Dap3Q9ER88 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dap3Q9ER88 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms