Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn12Q9ER56 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms