Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SrpraQ9DBG7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrpraQ9DBG7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms