Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SelenooQ9DBC0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SelenooQ9DBC0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SelenooQ9DBC0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SelenooQ9DBC0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SelenooQ9DBC0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SelenooQ9DBC0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SelenooQ9DBC0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SelenooQ9DBC0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SelenooQ9DBC0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SelenooQ9DBC0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SelenooQ9DBC0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SelenooQ9DBC0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SelenooQ9DBC0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SelenooQ9DBC0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SelenooQ9DBC0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SelenooQ9DBC0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SelenooQ9DBC0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SelenooQ9DBC0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SelenooQ9DBC0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SelenooQ9DBC0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SelenooQ9DBC0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SelenooQ9DBC0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms