Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Med29Q9DB91 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms