Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med27Q9DB40 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med27Q9DB40 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms