Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ccdc89Q9DA73 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc89Q9DA73 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc89Q9DA73 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms