Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ift43Q9DA69 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ift43Q9DA69 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift43Q9DA69 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift43Q9DA69 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift43Q9DA69 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift43Q9DA69 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift43Q9DA69 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift43Q9DA69 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift43Q9DA69 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift43Q9DA69 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift43Q9DA69 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift43Q9DA69 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift43Q9DA69 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift43Q9DA69 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift43Q9DA69 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift43Q9DA69 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift43Q9DA69 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift43Q9DA69 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ift43Q9DA69 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms