Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot8Q9D8X5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot8Q9D8X5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot8Q9D8X5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot8Q9D8X5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot8Q9D8X5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot8Q9D8X5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot8Q9D8X5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot8Q9D8X5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot8Q9D8X5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot8Q9D8X5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot8Q9D8X5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cnot8Q9D8X5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms