Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tvp23bQ9D8T4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms