Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jam3Q9D8B7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms