Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2af1Q9D883 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2af1Q9D883 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms