Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fip1l1Q9D824 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms