Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn22Q9D7U6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Cldn22Q9D7U6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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