Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn23Q9D7D7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn23Q9D7D7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn23Q9D7D7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn23Q9D7D7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn23Q9D7D7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn23Q9D7D7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn23Q9D7D7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn23Q9D7D7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn23Q9D7D7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn23Q9D7D7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn23Q9D7D7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn23Q9D7D7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn23Q9D7D7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn23Q9D7D7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn23Q9D7D7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn23Q9D7D7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn23Q9D7D7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn23Q9D7D7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Cldn23Q9D7D7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Cldn23Q9D7D7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn23Q9D7D7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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