Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J5

Ndufb8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb8Q9D6J5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndufb8Q9D6J5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufb8Q9D6J5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufb8Q9D6J5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufb8Q9D6J5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufb8Q9D6J5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufb8Q9D6J5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufb8Q9D6J5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufb8Q9D6J5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufb8Q9D6J5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufb8Q9D6J5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufb8Q9D6J5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufb8Q9D6J5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufb8Q9D6J5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufb8Q9D6J5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufb8Q9D6J5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ndufb8Q9D6J5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ndufb8Q9D6J5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb8Q9D6J5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms