Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cmtm5Q9D6G9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Cmtm5Q9D6G9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cmtm5Q9D6G9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cmtm5Q9D6G9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cmtm5Q9D6G9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cmtm5Q9D6G9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cmtm5Q9D6G9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cmtm5Q9D6G9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cmtm5Q9D6G9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cmtm5Q9D6G9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cmtm5Q9D6G9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cmtm5Q9D6G9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cmtm5Q9D6G9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cmtm5Q9D6G9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cmtm5Q9D6G9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cmtm5Q9D6G9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms