Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lpcat2bQ9D5U0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lpcat2bQ9D5U0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lpcat2bQ9D5U0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lpcat2bQ9D5U0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lpcat2bQ9D5U0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lpcat2bQ9D5U0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms