Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spsb1Q9D5L7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spsb1Q9D5L7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms