Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc83Q9D4V3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc83Q9D4V3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms