Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
4930564D02RikQ9D4S4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930564D02RikQ9D4S4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
4930564D02RikQ9D4S4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930564D02RikQ9D4S4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930564D02RikQ9D4S4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930564D02RikQ9D4S4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930564D02RikQ9D4S4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms