Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Efhd1Q9D4J1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Efhd1Q9D4J1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Efhd1Q9D4J1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
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Efhd1Q9D4J1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Efhd1Q9D4J1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms