Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lonrf3Q9D4H7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lonrf3Q9D4H7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms