Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D454 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D454 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D454 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D454 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D454 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D454 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D454 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D454 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D454 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D454 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D454 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D454 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D454 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D454 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D454 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D454 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D454 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D454 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D454 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D454 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D454 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D454 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D454 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D454 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D454 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D454 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D454 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D454 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D454 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D454 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D454 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D454 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D454 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D454 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D454 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D454 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D454 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D454 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D454 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D454 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D454 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D454 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D454 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D454 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D454 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D454 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D454 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D454 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D454 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D454 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D454 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D454 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D454 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D454 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D454 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D454 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D454 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D454 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D454 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D454 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D454 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D454 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D454 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D454 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D454 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D454 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D454 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D454 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D454 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D454 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D454 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D454 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D454 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D454 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D454 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Q9D454 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q9D454 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q9D454 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D454 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D454 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D454 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D454 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D454 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D454 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D454 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D454 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D454 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D454 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D454 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D454 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D454 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D454 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D454 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D454 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q9D454 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q9D454 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q9D454 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D454 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D454 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms