Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
4933428G20RikQ9D3X4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms