Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4933428M09RikQ9D3X3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms