Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rufy3Q9D394 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms