Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Q9D2Q3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms