Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F0

Rtl8b, CAAX box 1 homolog A (Human), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8bQ9D1F0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl8bQ9D1F0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtl8bQ9D1F0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms