Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cysrt1Q9D1E4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cysrt1Q9D1E4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms