Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms