Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem53Q9D0Z3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem53Q9D0Z3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms