Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtf2e1Q9D0D5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf2e1Q9D0D5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms