Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZS1

Aldh1b1, Aldehyde dehydrogenase X, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1b1Q9CZS1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1b1Q9CZS1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aldh1b1Q9CZS1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms