Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms