Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prelid3bQ9CYY7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prelid3bQ9CYY7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms