Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYQ5

Hcfc1r1, Host cell factor C1 regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms